Workshops
Digitization
techniques have been vastly employed for paleontological studies in the past
years, mainly in Image Segmentation for CT-scan data and Photogrammetry.
Photogrammetry translates with accuracy a physical object to the digital world.
This allows for collaboration with researchers across the globe and the study
of specimens when collection visits are not possible. With that in mind, some
paleontology journals are requesting digitalized specimens, and in doing so,
are allowing for the democratization of paleontology and the easy access to
published data.
The Photogrammetry workshop will approach basic concepts in photography and the different methods in photogrammetry. We
will discuss the techniques to make a good photogrammetry and show case-studies
of how to tackle fossils of different shapes and sizes. The instructors will
provide some datasets ready for the process of creating a 3D model, including
dinosaur tracks, vertebrate and invertebrate fossils. These datasets will go
through the general photogrammetry workflow, from the alignment of pictures to
the final textured 3D model, using the software Agisoft Metashape pro (a trial
version is free to download). We will then approach basic rendering and digital
measuring of fossils using the softwares MeshLab and Blender (both open source
softwares). We advise you all to download these softwares to follow our
workflow in real time, and hope you leave the workshop with the necessary
skills to create your own digital database.
Adrián Páramo Blázquez graduated in Geological Sciences at Universidad Complutense de Madrid (UCM), Spain, and obtained his PhD in Biology at Universidad Autónoma de Madrid (UAM), Spain. He studies the appendicular skeleton of sauropod dinosaurs using Geometric Morphometrics digitizing the specimens via Photogrammetry. He currently works as researcher at the Centro de Interpretación Paleontológica de La Rioja at Igea, Spain, applying this digitizing techniques to the conservation of geo-paleontological heritage.
Victor Beccari graduated in Biological Sciences at Universidade de São Paulo (USP), Brazil, and studies in the Master of Palaeontology at Universidade Nova de Lisboa (FCT-UNL), Portugal. He studies dinosaurs and pterosaurs, focussing on the anatomical description and 3D modelling, using Image Segmentation, Photogrammetry and sculpting in Blender.
(Pereira et al. 2021)
Una imagen vale más que mil palabras. Bueno, depende de la imagen... y depende de las palabras. Así como un texto mal escrito, mal construido, con errores ortográficos, pierde su valor y distrae al lector, por muy interesante que sea, una mala fotografía también quita todo el brillo y no hace justicia a un fósil, por muy atractivo que sea. La forma es tan importante como el contenido, y esto es aplicable tanto a la Paleontología... como a casi todo en nuestras vidas.
Por supuesto, el resultado dependerá de nuestro presupuesto, de las instalaciones y equipos que dispongamos y, por supuesto, de los materiales paleontológicos que queramos fotografiar... pero, amigos míos, esto es como tantas otras cosas que ahora no importan. Tenemos que saber cómo sacar el máximo partido a lo que tenemos a nuestra disposición, sea lo que sea.
(Colmenar et al. 2018)
En este breve curso, pretendemos enseñaros algunos conceptos y técnicas básicas sobre la fotografía de fósiles de invertebrados. No solo abordaremos la fotografía científica especializada (por ejemplo, para las láminas en publicaciones), sino también la fotografía de especímenes para su divulgación e incluso inventarios (¿quién no se ha arrepentido alguna vez de las fotos de mala calidad que hizo durante una visita a un museo importante?). Para ello, dividiremos el taller en dos partes. En la primera parte, presentaremos los contenidos, a saber 1) conceptos básicos de fotografía (profundidad de campo, ISO, velocidad de disparo, balance de blancos), 2) equipo (cámaras, objetivos, estativos, kits de luz), 3) técnicas con natural luz, 4) técnicas de macrofotografía de laboratorio (incluidos procesos de blanqueo, submersión de fósiles... pobres, tantos millones de años después vuelven al agua) y softwares de procesamiento (apilado y edición de imágenes). En la segunda parte, aplicaremos estas técnicas en 'vivo' (y 'muerto', el fósil) y compartiremos todo el proceso en directo desde la fotografía original hasta la imagen final.
Sofia Pereira (Centro de Geociencias, Universidad de Coimbra) y Jorge Colmenar (Instituto Geológico y Minero de España) son doctores en Paleontología y están especializados en trilobites (ella) y braquiópodos (él) del Ordovícico. Les encanta el trabajo de campo, pero de vez en cuando conviene publicar sus hallazgos y para eso fotografían tanto sus invertebrados como todos los demás que encuentren.
Digitization techniques have been vastly employed for paleontological studies in the past years, mainly in Image Segmentation for CT-scan data and Photogrammetry. Photogrammetry translates with accuracy a physical object to the digital world. This allows for collaboration with researchers across the globe and the study of specimens when collection visits are not possible. With that in mind, some paleontology journals are requesting digitalized specimens, and in doing so, are allowing for the democratization of paleontology and the easy access to published data.
The Photogrammetry workshop will approach basic concepts in photography and the different methods in photogrammetry. We will discuss the techniques to make a good photogrammetry and show case-studies of how to tackle fossils of different shapes and sizes. The instructors will provide some datasets ready for the process of creating a 3D model, including dinosaur tracks, vertebrate and invertebrate fossils. These datasets will go through the general photogrammetry workflow, from the alignment of pictures to the final textured 3D model, using the software Agisoft Metashape pro (a trial version is free to download). We will then approach basic rendering and digital measuring of fossils using the softwares MeshLab and Blender (both open source softwares). We advise you all to download these softwares to follow our workflow in real time, and hope you leave the workshop with the necessary skills to create your own digital database.
Adrián Páramo Blázquez graduated in Geological Sciences at Universidad Complutense de Madrid (UCM), Spain, and obtained his PhD in Biology at Universidad Autónoma de Madrid (UAM), Spain. He studies the appendicular skeleton of sauropod dinosaurs using Geometric Morphometrics digitizing the specimens via Photogrammetry. He currently works as researcher at the Centro de Interpretación Paleontológica de La Rioja at Igea, Spain, applying this digitizing techniques to the conservation of geo-paleontological heritage.
Victor Beccari graduated in Biological Sciences at Universidade de São Paulo (USP), Brazil, and studies in the Master of Palaeontology at Universidade Nova de Lisboa (FCT-UNL), Portugal. He studies dinosaurs and pterosaurs, focussing on the anatomical description and 3D modelling, using Image Segmentation, Photogrammetry and sculpting in Blender.
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